Enligt tysk media är det fråga om Big Maple Leaf, ett minnesmynt som präglades av det kanadensiska myntverket för tio år sedan.
Myntet är 53 centimeter i diameter och tre centimeter tjockt. Det pryds av brittiska drottning Elizabeth II.
Enligt museet är myntets nominella värde 920 000 euro, men marknadspriset på 100 kilogram guld ligger kring 3,7 miljoner euro.
Tyska polisen säger på
Twitter att rånarna troligen använde en stege för att bryta sig in i museet vid halv fyratiden på måndagen.
Bodemuseet ligger på en ö mitt i centrala Berlin och har en av världens största myntsamlingar.
Utrikes
27.3.2017
100-kilos guldmynt stals i Berlin
Tjuvar har stulit ett guldmynt som väger 100 kilo från Bodemuseum i Berlin.